Исполнительно-распорядительным органом епархии, находящимся под непосредственным руководством епархиального архиерея, является Епархиальное управление, которое имеет свою канцелярию, бухгалтерию, архив и иные вспомогательные отделы, обеспечивающие разнообразные виды епархиальной деятельности.

Епархия разделяется на благочиннические округа во главе с благочинными, назначаемыми епархиальным архиереем. Сегодня в Сарапульской епархии 7 благочиннических округов.

Благочиннические округа объединяют 82 прихода.

В 2023 году в Сарапульской епархии совершают служение 68 человек, из них священников — 64, диаконов —4.